الكارنيتين له فوائد عديدة للجسم، وأهمها في عملية فقد الدهون وتحديداً بعملية أكسدة الاحماض الدهنية، فالكارنيتين مسئول عن نقل الأحماض الدهنية للميتوكوندريا في الخلايا، وهناك تستعمل الاحماض الدهنية لإنتاج الطاقة المهمة جداً للجسم. فالسلاسل الطويلة من الدهون المشبعة من الأحماض الدهنية لها قابلية ضعيفة جداً ومحدودة لاجتياز الجدار الداخلي للميتوكندريا عندما تكون على شكل CoA ثيو إستر ، ولكن هذه القابلية تزيد بتحفيز الكارنتين، وهنا تكمن الاهمية